经过多年建设，澳科大现有三个国家级研究平台：中药质量研究国家重点实验室、月球与行星科学国家重点实验室和澳门海岸带生态环境国家野外科学观测研究站。
此外还建立了多个重大的研究院所及研究中心，如澳门药物及健康应用研究院、可持续发展研究所、太空科学研究所、澳门社会和文化研究所、澳门系统工程研究所、澳门中药国际标准中心、仲裁与争议解决研究中心、澳门传媒研究中心、澳门环境研究院、澳门金融科技创新研究院、澳门智慧城市研究院、澳门电影艺术研究院、澳门建筑与城市规划研究院、下一代互联网国际研究院、澳门创新中药与产业化技术创新中心、智能机器人技术创新中心、澳门数学研究中心、澳门拉丁美洲研究中心、中国历史研究院澳门历史研究中心、澳门知识产权服务中心。
澳科大还设立了澳门首个诺贝尔奖得主命名的实验室“埃尔文内尔博士生物物理与创新药物实验室”。获国家教育部批准，澳科大与内地五所高校共同建立人文社科重点研究伙伴基地及联合实验室。
国际化是大学发展的强劲动力，也是大学发展的重要方向。在学术管理上，澳科大根据澳门的社会及人文特点，充分吸纳国际知名学府的经验，建立适应大学国际化发展的管理理念与文化、管理模式与架构、管理制度与程序等，创办具有先进管理水平的国际型大学。
目前，澳科大在教育课程、学术研究、人才培训、学生交流等领域，已与欧洲、美洲、澳洲及中国内地、台湾、香港等超过200多所教研机构建立了多种形式的合作关系，也是亚太大学联合会（ AUAP ）及国际大学联合会（ IAU ）成员，并且自2022年3月起已成为泰晤士高等教育「 THE Campus + 」的合作伙伴。
澳科大鼓励学生海外交流，为优异生提供长、中、短期海外研习资助，大力支持毕业生向海外继续升学或就业，包括保荐学生升读海外研究生课程等。
澳科大注重学生综合能力培养，使学生全人发展，具竞争优势。毕业生广受社会和雇主欢迎，升学及就业前景好，根据大学创业就业发展中心调查统计，约40%毕业生选择继续深造，部分学生升读世界前50强大学；约60%毕业生选择就业，大部份学生在毕业前或毕业时已被知名跨国企业、独角兽企业等聘用。
